Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRABDQ9H4I3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRABDQ9H4I3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms