Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIXL1Q9H2W2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIXL1Q9H2W2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MIXL1Q9H2W2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms