Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC68Q9H2F9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC68Q9H2F9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC68Q9H2F9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC68Q9H2F9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms