Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL25Q9H0H3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL25Q9H0H3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL25Q9H0H3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL25Q9H0H3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms