Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM2Q9C040 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM2Q9C040 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM2Q9C040 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms