Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERP44Q9BS26 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERP44Q9BS26 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERP44Q9BS26 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms