Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPKQ9BS16 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPKQ9BS16 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPKQ9BS16 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPKQ9BS16 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms