Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSG101Q99816 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSG101Q99816 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSG101Q99816 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSG101Q99816 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSG101Q99816 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSG101Q99816 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TSG101Q99816 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSG101Q99816 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSG101Q99816 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSG101Q99816 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSG101Q99816 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSG101Q99816 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSG101Q99816 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSG101Q99816 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSG101Q99816 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSG101Q99816 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSG101Q99816 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSG101Q99816 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSG101Q99816 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms