Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK1Q96QP1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK1Q96QP1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALPK1Q96QP1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALPK1Q96QP1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALPK1Q96QP1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALPK1Q96QP1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK1Q96QP1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPK1Q96QP1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALPK1Q96QP1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms