Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00167Q96N53 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms