Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUB1Q96FW1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
OTUB1Q96FW1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTUB1Q96FW1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms