Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
SNX21Q969T3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SNX21Q969T3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SNX21Q969T3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNX21Q969T3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SNX21Q969T3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SNX21Q969T3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SNX21Q969T3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SNX21Q969T3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SNX21Q969T3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SNX21Q969T3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SNX21Q969T3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNX21Q969T3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNX21Q969T3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNX21Q969T3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNX21Q969T3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNX21Q969T3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SNX21Q969T3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SNX21Q969T3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SNX21Q969T3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SNX21Q969T3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SNX21Q969T3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SNX21Q969T3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SNX21Q969T3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SNX21Q969T3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SNX21Q969T3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SNX21Q969T3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SNX21Q969T3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SNX21Q969T3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SNX21Q969T3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SNX21Q969T3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SNX21Q969T3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SNX21Q969T3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SNX21Q969T3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SNX21Q969T3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms