Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRN2Q92932 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRN2Q92932 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRN2Q92932 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRN2Q92932 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRN2Q92932 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRN2Q92932 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRN2Q92932 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRN2Q92932 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRN2Q92932 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRN2Q92932 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRN2Q92932 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRN2Q92932 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRN2Q92932 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRN2Q92932 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRN2Q92932 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRN2Q92932 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRN2Q92932 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRN2Q92932 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRN2Q92932 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRN2Q92932 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRN2Q92932 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRN2Q92932 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRN2Q92932 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRN2Q92932 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRN2Q92932 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRN2Q92932 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRN2Q92932 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRN2Q92932 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRN2Q92932 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRN2Q92932 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRN2Q92932 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRN2Q92932 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRN2Q92932 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRN2Q92932 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRN2Q92932 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRN2Q92932 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRN2Q92932 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRN2Q92932 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRN2Q92932 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRN2Q92932 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRN2Q92932 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRN2Q92932 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRN2Q92932 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRN2Q92932 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRN2Q92932 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRN2Q92932 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRN2Q92932 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRN2Q92932 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRN2Q92932 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRN2Q92932 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRN2Q92932 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRN2Q92932 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRN2Q92932 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRN2Q92932 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms