Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC8Q8TC99 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC8Q8TC99 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC8Q8TC99 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC8Q8TC99 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC8Q8TC99 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FNDC8Q8TC99 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC8Q8TC99 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC8Q8TC99 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC8Q8TC99 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC8Q8TC99 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC8Q8TC99 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC8Q8TC99 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC8Q8TC99 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC8Q8TC99 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC8Q8TC99 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC8Q8TC99 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC8Q8TC99 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC8Q8TC99 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC8Q8TC99 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC8Q8TC99 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC8Q8TC99 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC8Q8TC99 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FNDC8Q8TC99 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms