Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA6DQ8NFY4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA6DQ8NFY4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms