Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP43Q8NFH3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP43Q8NFH3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP43Q8NFH3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP43Q8NFH3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP43Q8NFH3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP43Q8NFH3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP43Q8NFH3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP43Q8NFH3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP43Q8NFH3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP43Q8NFH3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP43Q8NFH3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP43Q8NFH3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP43Q8NFH3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP43Q8NFH3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP43Q8NFH3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP43Q8NFH3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP43Q8NFH3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP43Q8NFH3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms