Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3C3Q8NEB9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3C3Q8NEB9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PIK3C3Q8NEB9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms