Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIPK4Q8NE63 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIPK4Q8NE63 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HIPK4Q8NE63 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms