Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDPRQ8NCN5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDPRQ8NCN5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDPRQ8NCN5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDPRQ8NCN5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDPRQ8NCN5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDPRQ8NCN5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDPRQ8NCN5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDPRQ8NCN5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDPRQ8NCN5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDPRQ8NCN5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDPRQ8NCN5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDPRQ8NCN5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDPRQ8NCN5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDPRQ8NCN5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDPRQ8NCN5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDPRQ8NCN5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDPRQ8NCN5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDPRQ8NCN5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDPRQ8NCN5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDPRQ8NCN5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms