Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C17orf53Q8N3J3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C17orf53Q8N3J3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C17orf53Q8N3J3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C17orf53Q8N3J3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C17orf53Q8N3J3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C17orf53Q8N3J3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C17orf53Q8N3J3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C17orf53Q8N3J3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C17orf53Q8N3J3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C17orf53Q8N3J3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C17orf53Q8N3J3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C17orf53Q8N3J3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C17orf53Q8N3J3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C17orf53Q8N3J3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
C17orf53Q8N3J3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C17orf53Q8N3J3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C17orf53Q8N3J3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C17orf53Q8N3J3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C17orf53Q8N3J3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C17orf53Q8N3J3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C17orf53Q8N3J3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C17orf53Q8N3J3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C17orf53Q8N3J3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
C17orf53Q8N3J3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms