Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.364e-9■■■■■ 58.6
AGGF1Q8N302 AGAP1-203ENST00000402604 563 ntTSL 411.92□□□□□ -0.54e-9■■■■■ 58.6
AGGF1Q8N302 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.214e-7■■■■■ 58.3
AGGF1Q8N302 KLHL26-203ENST00000595423 554 ntTSL 222.1■■□□□ 1.134e-7■■■■■ 58.3
AGGF1Q8N302 KLHL26-206ENST00000600657 577 ntTSL 418.84■□□□□ 0.614e-7■■■■■ 58.3
AGGF1Q8N302 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.594e-7■■■■■ 58.3
AGGF1Q8N302 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.144e-7■■■■■ 58.3
AGGF1Q8N302 KLHL26-204ENST00000596843 541 ntTSL 415.45■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 58.3
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AGGF1Q8N302 MYEOV-212ENST00000544781 585 ntTSL 28.94□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 58.1
AGGF1Q8N302 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.122e-7■■■■■ 58.1
AGGF1Q8N302 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 58.1
AGGF1Q8N302 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 58.1
AGGF1Q8N302 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 58.1
AGGF1Q8N302 ALOX12-AS1-205ENST00000572385 576 ntTSL 412.91□□□□□ -0.342e-13■■■■■ 58
AGGF1Q8N302 ALOX12-AS1-203ENST00000570562 567 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.692e-13■■■■■ 58
AGGF1Q8N302 ALOX12-AS1-209ENST00000575889 439 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.882e-13■■■■■ 58
AGGF1Q8N302 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.371e-42■■■■■ 57.9
AGGF1Q8N302 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.356e-8■■■■■ 57.9
AGGF1Q8N302 RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.47■□□□□ 0.236e-8■■■■■ 57.9
AGGF1Q8N302 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.166e-8■■■■■ 57.9
AGGF1Q8N302 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.166e-8■■■■■ 57.9
AGGF1Q8N302 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.086e-8■■■■■ 57.9
AGGF1Q8N302 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.36e-8■■■■■ 57.9
AGGF1Q8N302 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.353e-10■■■■■ 57.9
AGGF1Q8N302 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.443e-10■■■■■ 57.9
AGGF1Q8N302 F7-202ENST00000375581 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.483e-10■■■■■ 57.9
AGGF1Q8N302 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.862e-9■■■■■ 57.9
AGGF1Q8N302 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.762e-9■■■■■ 57.9
AGGF1Q8N302 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.762e-9■■■■■ 57.9
AGGF1Q8N302 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 57.8
AGGF1Q8N302 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 57.8
AGGF1Q8N302 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 57.8
AGGF1Q8N302 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 57.8
AGGF1Q8N302 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 57.8
AGGF1Q8N302 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 57.8
AGGF1Q8N302 CUX1-218ENST00000560541 3176 ntTSL 511.84□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 57.8
AGGF1Q8N302 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 57.8
AGGF1Q8N302 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 57.8
AGGF1Q8N302 CUX1-217ENST00000558836 2965 ntTSL 511.06□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 57.8
AGGF1Q8N302 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 57.8
AGGF1Q8N302 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 57.8
AGGF1Q8N302 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 57.8
AGGF1Q8N302 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.852e-7■■■■■ 57.8
AGGF1Q8N302 EGFR-211ENST00000638463 4735 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 57.7
AGGF1Q8N302 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.877e-10■■■■■ 57.4
AGGF1Q8N302 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.322e-16■■■■■ 57.3
AGGF1Q8N302 TRAPPC9-215ENST00000524162 591 ntTSL 420.29■□□□□ 0.842e-7■■■■■ 56.9
AGGF1Q8N302 TRAPPC9-214ENST00000523777 705 ntTSL 315.82■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 56.9
AGGF1Q8N302 TRAPPC9-213ENST00000522504 665 ntTSL 314.34□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 56.9
AGGF1Q8N302 TRAPPC9-206ENST00000519482 551 ntTSL 411.9□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 56.9
AGGF1Q8N302 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.531e-16■■■■■ 56.7
AGGF1Q8N302 UBE2O-202ENST00000586409 3579 ntTSL 216.88■□□□□ 0.291e-16■■■■■ 56.7
AGGF1Q8N302 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.472e-16■■■■■ 56.3
AGGF1Q8N302 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.022e-16■■■■■ 56.3
AGGF1Q8N302 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.542e-16■■■■■ 56.3
AGGF1Q8N302 C16orf95-202ENST00000562840 1650 ntTSL 218.75■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 56.2
AGGF1Q8N302 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 56.1
AGGF1Q8N302 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 56.1
AGGF1Q8N302 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 56.1
AGGF1Q8N302 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.295e-7■■■■■ 56.1
AGGF1Q8N302 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.844e-8■■■■■ 56.1
AGGF1Q8N302 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.544e-8■■■■■ 56.1
AGGF1Q8N302 ARHGAP8-207ENST00000447333 768 ntTSL 517.75■□□□□ 0.434e-8■■■■■ 56.1
AGGF1Q8N302 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.384e-8■■■■■ 56.1
AGGF1Q8N302 ARHGAP8-203ENST00000389772 1474 ntTSL 1 (best)17.17■□□□□ 0.344e-8■■■■■ 56.1
AGGF1Q8N302 ARHGAP8-208ENST00000460809 2905 ntTSL 216.51■□□□□ 0.234e-8■■■■■ 56.1
AGGF1Q8N302 ARHGAP8-206ENST00000412433 581 ntTSL 314.99□□□□□ -0.014e-8■■■■■ 56.1
AGGF1Q8N302 ARHGAP8-212ENST00000498310 732 ntTSL 314.2□□□□□ -0.144e-8■■■■■ 56.1
AGGF1Q8N302 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.852e-7■■■■■ 56.1
AGGF1Q8N302 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 56.1
AGGF1Q8N302 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 56.1
AGGF1Q8N302 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 56.1
AGGF1Q8N302 TRAPPC9-210ENST00000521667 2021 ntTSL 1 (best)19.04■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 56
AGGF1Q8N302 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.392e-26■■■■■ 55.9
AGGF1Q8N302 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 55.9
AGGF1Q8N302 TRAPPC9-208ENST00000520857 3693 ntTSL 1 (best)13.67□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 55.9
AGGF1Q8N302 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 55.9
AGGF1Q8N302 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.077e-9■■■■■ 55.8
AGGF1Q8N302 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.777e-9■■■■■ 55.8
AGGF1Q8N302 NLRP1-205ENST00000544378 5281 ntTSL 214.02□□□□□ -0.167e-9■■■■■ 55.8
AGGF1Q8N302 NLRP1-201ENST00000262467 5131 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.517e-9■■■■■ 55.8
AGGF1Q8N302 NLRP1-215ENST00000613500 4494 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.717e-9■■■■■ 55.8
AGGF1Q8N302 NLRP1-212ENST00000574512 4506 ntTSL 1 (best)7.4□□□□□ -1.227e-9■■■■■ 55.8
AGGF1Q8N302 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.384e-8■■■■■ 55.8
AGGF1Q8N302 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.164e-8■■■■■ 55.8
AGGF1Q8N302 TMC6-220ENST00000591756 475 ntTSL 217.17■□□□□ 0.348e-16■■■■■ 55.3
AGGF1Q8N302 TMC6-217ENST00000590934 386 ntTSL 511.91□□□□□ -0.58e-16■■■■■ 55.3
AGGF1Q8N302 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.013e-9■■■■■ 55.3
AGGF1Q8N302 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.063e-9■■■■■ 55.3
AGGF1Q8N302 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.223e-9■■■■■ 55.3
AGGF1Q8N302 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.593e-9■■■■■ 55.3
AGGF1Q8N302 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 55.3
AGGF1Q8N302 SLC9A8-202ENST00000417961 6309 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 55.3
AGGF1Q8N302 GNAS-243ENST00000484504 662 ntTSL 227.36■■□□□ 1.973e-8■■■■■ 55.1
AGGF1Q8N302 GNAS-244ENST00000485673 715 ntTSL 527.36■■□□□ 1.973e-8■■■■■ 55.1
AGGF1Q8N302 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.793e-8■■■■■ 55.1
AGGF1Q8N302 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.793e-8■■■■■ 55.1
AGGF1Q8N302 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.793e-8■■■■■ 55.1
AGGF1Q8N302 GNAS-256ENST00000603546 573 ntTSL 525.9■■□□□ 1.743e-8■■■■■ 55.1
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