Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
SKAP1Q86WV1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SKAP1Q86WV1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SKAP1Q86WV1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SKAP1Q86WV1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SKAP1Q86WV1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SKAP1Q86WV1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
SKAP1Q86WV1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SKAP1Q86WV1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SKAP1Q86WV1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SKAP1Q86WV1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SKAP1Q86WV1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SKAP1Q86WV1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SKAP1Q86WV1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SKAP1Q86WV1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SKAP1Q86WV1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SKAP1Q86WV1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SKAP1Q86WV1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SKAP1Q86WV1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
SKAP1Q86WV1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
SKAP1Q86WV1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SKAP1Q86WV1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SKAP1Q86WV1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SKAP1Q86WV1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SKAP1Q86WV1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SKAP1Q86WV1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SKAP1Q86WV1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SKAP1Q86WV1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SKAP1Q86WV1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
SKAP1Q86WV1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SKAP1Q86WV1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SKAP1Q86WV1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms