Protein–RNA interactions for Protein: Q86W54

SPATA24, Spermatogenesis-associated protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA24Q86W54 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA24Q86W54 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA24Q86W54 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA24Q86W54 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA24Q86W54 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA24Q86W54 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA24Q86W54 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA24Q86W54 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA24Q86W54 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA24Q86W54 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA24Q86W54 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA24Q86W54 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA24Q86W54 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA24Q86W54 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA24Q86W54 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA24Q86W54 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA24Q86W54 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA24Q86W54 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA24Q86W54 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPATA24Q86W54 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA24Q86W54 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA24Q86W54 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms