Protein–RNA interactions for Protein: Q86U02

LINC00596, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00596, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00596Q86U02 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00596Q86U02 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00596Q86U02 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00596Q86U02 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00596Q86U02 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00596Q86U02 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00596Q86U02 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00596Q86U02 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00596Q86U02 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00596Q86U02 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00596Q86U02 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00596Q86U02 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00596Q86U02 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00596Q86U02 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00596Q86U02 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00596Q86U02 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00596Q86U02 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00596Q86U02 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00596Q86U02 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00596Q86U02 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00596Q86U02 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159 ms