Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J2

C16orf62, UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62Q7Z3J2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C16orf62Q7Z3J2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C16orf62Q7Z3J2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C16orf62Q7Z3J2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C16orf62Q7Z3J2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C16orf62Q7Z3J2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C16orf62Q7Z3J2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C16orf62Q7Z3J2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C16orf62Q7Z3J2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C16orf62Q7Z3J2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf62Q7Z3J2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf62Q7Z3J2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf62Q7Z3J2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf62Q7Z3J2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C16orf62Q7Z3J2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
C16orf62Q7Z3J2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C16orf62Q7Z3J2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C16orf62Q7Z3J2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C16orf62Q7Z3J2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C16orf62Q7Z3J2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C16orf62Q7Z3J2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C16orf62Q7Z3J2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C16orf62Q7Z3J2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C16orf62Q7Z3J2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C16orf62Q7Z3J2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C16orf62Q7Z3J2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms