Protein–RNA interactions for Protein: Q7L7L0

HIST3H2A, Histone H2A type 3, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H2AQ7L7L0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIST3H2AQ7L7L0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIST3H2AQ7L7L0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIST3H2AQ7L7L0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIST3H2AQ7L7L0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST3H2AQ7L7L0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST3H2AQ7L7L0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST3H2AQ7L7L0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST3H2AQ7L7L0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST3H2AQ7L7L0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST3H2AQ7L7L0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.1 ms