Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0Q8

RHOU, Rho-related GTP-binding protein RhoU, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOUQ7L0Q8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOUQ7L0Q8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOUQ7L0Q8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOUQ7L0Q8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOUQ7L0Q8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOUQ7L0Q8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOUQ7L0Q8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOUQ7L0Q8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOUQ7L0Q8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOUQ7L0Q8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOUQ7L0Q8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOUQ7L0Q8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOUQ7L0Q8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms