Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC80Q76M96 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC80Q76M96 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms