Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNI2Q6ZMN8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNI2Q6ZMN8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNI2Q6ZMN8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNI2Q6ZMN8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNI2Q6ZMN8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNI2Q6ZMN8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNI2Q6ZMN8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCNI2Q6ZMN8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCNI2Q6ZMN8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCNI2Q6ZMN8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNI2Q6ZMN8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms