Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF549Q6P9A3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF549Q6P9A3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF549Q6P9A3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms