Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC70Q6NSX1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC70Q6NSX1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC70Q6NSX1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms