Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH5

PRAMEF7, PRAME family member 7, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF7Q5VXH5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF7Q5VXH5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF7Q5VXH5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF7Q5VXH5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF7Q5VXH5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF7Q5VXH5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF7Q5VXH5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF7Q5VXH5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAMEF7Q5VXH5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF7Q5VXH5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF7Q5VXH5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF7Q5VXH5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF7Q5VXH5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF7Q5VXH5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF7Q5VXH5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF7Q5VXH5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF7Q5VXH5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms