Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIPR1Q53HC9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EIPR1Q53HC9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EIPR1Q53HC9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms