Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFTN2Q52LD8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFTN2Q52LD8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFTN2Q52LD8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms