Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNW1

SNAI3, Zinc finger protein SNAI3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3Q3KNW1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAI3Q3KNW1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAI3Q3KNW1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAI3Q3KNW1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAI3Q3KNW1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNAI3Q3KNW1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms