Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CSPP1Q1MSJ5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSPP1Q1MSJ5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSPP1Q1MSJ5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms