Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIST2H2ACQ16777 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIST2H2ACQ16777 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIST2H2ACQ16777 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIST2H2ACQ16777 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIST2H2ACQ16777 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIST2H2ACQ16777 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HIST2H2ACQ16777 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIST2H2ACQ16777 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIST2H2ACQ16777 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIST2H2ACQ16777 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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