Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACKR1Q16570 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACKR1Q16570 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms