Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYPL1Q16563 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYPL1Q16563 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPL1Q16563 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYPL1Q16563 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYPL1Q16563 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYPL1Q16563 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYPL1Q16563 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPL1Q16563 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPL1Q16563 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPL1Q16563 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPL1Q16563 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPL1Q16563 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPL1Q16563 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPL1Q16563 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPL1Q16563 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms