Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERV3-1Q14264 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERV3-1Q14264 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms