Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX39BQ13838 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX39BQ13838 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX39BQ13838 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX39BQ13838 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
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