Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HDAC1Q13547 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HDAC1Q13547 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HDAC1Q13547 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HDAC1Q13547 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HDAC1Q13547 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HDAC1Q13547 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HDAC1Q13547 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HDAC1Q13547 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HDAC1Q13547 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HDAC1Q13547 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HDAC1Q13547 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HDAC1Q13547 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HDAC1Q13547 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
HDAC1Q13547 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HDAC1Q13547 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
HDAC1Q13547 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
HDAC1Q13547 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HDAC1Q13547 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.65
HDAC1Q13547 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HDAC1Q13547 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
HDAC1Q13547 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HDAC1Q13547 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
HDAC1Q13547 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
HDAC1Q13547 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
HDAC1Q13547 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HDAC1Q13547 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HDAC1Q13547 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HDAC1Q13547 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
HDAC1Q13547 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
HDAC1Q13547 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
HDAC1Q13547 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
HDAC1Q13547 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HDAC1Q13547 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HDAC1Q13547 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HDAC1Q13547 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms