Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB3Q13509 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB3Q13509 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB3Q13509 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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