Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDAP1Q13442 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDAP1Q13442 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDAP1Q13442 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDAP1Q13442 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDAP1Q13442 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDAP1Q13442 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDAP1Q13442 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDAP1Q13442 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDAP1Q13442 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDAP1Q13442 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDAP1Q13442 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDAP1Q13442 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDAP1Q13442 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDAP1Q13442 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDAP1Q13442 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDAP1Q13442 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDAP1Q13442 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDAP1Q13442 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PDAP1Q13442 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms