Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P3Q13401 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS2P3Q13401 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMS2P3Q13401 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMS2P3Q13401 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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