Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BNIP3Q12983 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BNIP3Q12983 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BNIP3Q12983 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP3Q12983 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BNIP3Q12983 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BNIP3Q12983 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BNIP3Q12983 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BNIP3Q12983 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BNIP3Q12983 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BNIP3Q12983 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BNIP3Q12983 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BNIP3Q12983 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BNIP3Q12983 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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