Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4Q12950 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4Q12950 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms