Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN13Q12923 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN13Q12923 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN13Q12923 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN13Q12923 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
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