Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CAMSAP2Q08AD1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CAMSAP2Q08AD1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CAMSAP2Q08AD1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC39■■■■□ 3.83
CAMSAP2Q08AD1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
CAMSAP2Q08AD1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CAMSAP2Q08AD1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CAMSAP2Q08AD1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CAMSAP2Q08AD1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CAMSAP2Q08AD1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CAMSAP2Q08AD1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CAMSAP2Q08AD1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CAMSAP2Q08AD1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CAMSAP2Q08AD1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CAMSAP2Q08AD1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CAMSAP2Q08AD1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CAMSAP2Q08AD1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CAMSAP2Q08AD1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CAMSAP2Q08AD1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CAMSAP2Q08AD1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CAMSAP2Q08AD1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
CAMSAP2Q08AD1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CAMSAP2Q08AD1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CAMSAP2Q08AD1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CAMSAP2Q08AD1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
CAMSAP2Q08AD1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CAMSAP2Q08AD1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CAMSAP2Q08AD1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CAMSAP2Q08AD1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CAMSAP2Q08AD1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CAMSAP2Q08AD1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CAMSAP2Q08AD1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CAMSAP2Q08AD1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CAMSAP2Q08AD1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CAMSAP2Q08AD1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
CAMSAP2Q08AD1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CAMSAP2Q08AD1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CAMSAP2Q08AD1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CAMSAP2Q08AD1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CAMSAP2Q08AD1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CAMSAP2Q08AD1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CAMSAP2Q08AD1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CAMSAP2Q08AD1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CAMSAP2Q08AD1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CAMSAP2Q08AD1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CAMSAP2Q08AD1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
CAMSAP2Q08AD1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CAMSAP2Q08AD1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
CAMSAP2Q08AD1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CAMSAP2Q08AD1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CAMSAP2Q08AD1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CAMSAP2Q08AD1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CAMSAP2Q08AD1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CAMSAP2Q08AD1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CAMSAP2Q08AD1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CAMSAP2Q08AD1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CAMSAP2Q08AD1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CAMSAP2Q08AD1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
CAMSAP2Q08AD1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CAMSAP2Q08AD1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CAMSAP2Q08AD1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CAMSAP2Q08AD1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CAMSAP2Q08AD1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CAMSAP2Q08AD1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CAMSAP2Q08AD1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CAMSAP2Q08AD1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.79
CAMSAP2Q08AD1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
CAMSAP2Q08AD1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CAMSAP2Q08AD1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
CAMSAP2Q08AD1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CAMSAP2Q08AD1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CAMSAP2Q08AD1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CAMSAP2Q08AD1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CAMSAP2Q08AD1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CAMSAP2Q08AD1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CAMSAP2Q08AD1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CAMSAP2Q08AD1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CAMSAP2Q08AD1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
CAMSAP2Q08AD1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CAMSAP2Q08AD1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CAMSAP2Q08AD1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CAMSAP2Q08AD1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CAMSAP2Q08AD1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CAMSAP2Q08AD1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CAMSAP2Q08AD1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CAMSAP2Q08AD1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CAMSAP2Q08AD1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CAMSAP2Q08AD1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
CAMSAP2Q08AD1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CAMSAP2Q08AD1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CAMSAP2Q08AD1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CAMSAP2Q08AD1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
CAMSAP2Q08AD1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CAMSAP2Q08AD1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
CAMSAP2Q08AD1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CAMSAP2Q08AD1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CAMSAP2Q08AD1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CAMSAP2Q08AD1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CAMSAP2Q08AD1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CAMSAP2Q08AD1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms