Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUDPQ08623 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUDPQ08623 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms